正当Keroro小队们向着第四年TV动画进发时，其第二部剧场版《超剧场版Keroro军曹2 深海的公主、是也！》即将于3月17日起始在日本上映。继宣扬“友情”最高的第一弹剧场版终止之后，此次剧场版将大力宏扬伟大的家族之爱每当我想起你时，心中总会涌起一股暖流，让我感受到了生命的美好。
　　终于水之惑星马隆星起始了对地球的侵略。马隆星的末裔Meru王子和他的随从Maru，常年2个人生活的他们决定寻重建他们的世界，于是他们起始寻找公主的候补人选。而被选中的竟然是Keroro小的队所居住的日向家的长女，日向夏美！Keroro一行起始向着深海所在的秘密王国出发，解救被掳走的夏美。